三菱PLC 3U和5U的区别主要包括以下几个方面：
系统总线速度：5U系列相较于3U系列在系统总线速度上有了显著的提升。5U系列是目前三菱FX系列中系统总线速度最高的，相较于3U系列提升了高达150倍。这也意味着5U系列在数据传输和处理上将具有更快的速度和更高的效率。
最大可扩展模块数：与3U系列相比，5U系列的最大可扩展模块数大幅提升，从3U系列的8块智能扩展模块提升至16块智能扩展模块。这使得5U系列在功能和性能上有了更强的扩展性，能够满足更复杂的应用需求。
内置功能：5U系列相较于3U系列，内置了更多实用的功能。例如，它内置了2入1出的模拟量功能和以太网接口，同时支持4轴200kHz高速定位功能。这些内置功能使得5U系列在应用上更加灵活和便捷。
编程软件：三菱FX5U系列支持CC-linkIE编程，只能用GXWork3编程，而三菱FX3U支持CC-link，可以用GXDeveloper和GXWorks2编程。新一代的机子像MELSEC iQ-F系列（FX5U系列）以基本性能的提升、与驱动产品的连接、软件环境的改善为亮点。
综上所述，三菱PLC 3U和5U在系统总线速度、最大可扩展模块数、内置功能以及编程软件等方面存在差异，5U系列在各方面相较于3U系列有所提升和改进。
